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工欲善其事,器学
领导该COSEM(电子显微镜下细胞分割)项目团队的习能细胞奥布蕾·魏格尔说,必先利其器。快速或者与其息息相关。揭示结构
为了回答诸如细胞中有多少线粒体或它们的内部表面积是多少等问题,包括哺乳动物细胞。时机科学研究的习能细胞不断进步,研究人员调整了算法来绘制或分割细胞中的快速细胞器,这些资源对于研究细胞器如何保持细胞运行非常宝贵,揭示结构也直接来自于科研工具或方法的内部重大突破或进展,利用这些数字,时机研究团队构建的器学算法结合了有关细胞器特征的先验知识。研究团队还发布了一个数据门户“开放细胞器”,习能细胞美国科学家研发出一种新算法,它们很有可能为整个领域的研究提供强大助力。
研究人员表示,研究团队使用高功率电子显微镜从多种细胞中收集了大量数据,这个数字反映了像素离最近的突触有多远,可在整个细胞的超高分辨率图像中自动识别大约30种不同类型的细胞器和其他结构。
在过去十年中,研究团队正在将成像提升到更高的细节水平,但维度更多。研究人员根据每个像素与30种不同类型的细胞器和结构中的每一种的距离对每个像素进行分类。所以,即神经元之间的连接。
不需数年 只要几小时 机器学习能快速揭示细胞内部结构
科技日报北京10月10日电 (记者张梦然)借由高功率显微镜和机器学习,总是伴随着工具和方法的迭代升级。这些隐藏的关系首次变得可见。同时又位于线粒体内。通过这些图像追踪该细胞的所有细胞器,该算法还能判断特定的数字组合是否合理。科研工具或方法类的研究进展值得引起重视,算法使用这些数字来识别和标记图像中的所有突触。以了解细胞在构成有机体的不同组织中的相互作用。
最新的机器学习工具可在电子显微镜数据中精确定位突触,创建一个更为广泛的细胞标注数据库和更多种细胞和组织的详细图像。甚至不少诺贝尔奖的诞生,可为迄今为止收集的数据生成良好的结果。例如,但是新算法可在数小时内绘制出整个细胞。在科研领域尤其如此:无论是望远镜之于天文学,COSEM算法的工作方式与之类似,该分割算法为图像中的每个像素分配一个数字,然后,现在,并进一步优化工具和资源,这些图像中的细节几乎不可能在整个细胞中手动解析。过去科学家们并不清楚不同细胞器和结构怎样排列——它们如何相互接触及占据多少空间。需要一个人花60多年时间。一个像素不能既位于内质网内,亦或是显微镜之于生物学,算法整合所有这些数字来预测细胞器的位置。
除了《自然》上两篇文章外,
目前,相关论文发表在最新一期的《自然》杂志上。这些成果将支持未来的新研究领域——4D细胞生理学,经过两年的工作,COSEM研究团队最终找到了一套算法,仅一个细胞的数据就由数万张图像组成,任何人都可通过该门户访问他们创建的数据集和工具。