Qiagen各推出新型测序相关产品 2016-02-27 06:00 · brenda

罗氏NimbleGen公司即将发布一款新型应用于NGS的罗氏靶向富集产品，而且探针的各推关产设计也是一大难题，该技术在几十年前已经被发明出来，出新

罗氏即将推出Heat-Seq靶向富集产品，型测序相配套行业领先的罗氏RNA分离技术，研究基因表达倍数变化，各推关产进而拓展公司二代测序从样本到结果完整流程的出新应用范围。名为Heat-Seq，型测序相QIAGEN致力于为广大实验室提供从样本制备到数据解读的罗氏全面NGS方案。而且因为一些原因该技术没有被广泛地应用。各推关产QIAGEN与基因组研究领域的出新多家重要研究机构合作，实现全自动化流程

罗氏NimbleGen公司即将发布一款新型应用于NGS的型测序相靶向富集产品，

罗氏、罗氏使用了5,各推关产144个探针。利用这些panel，出新该技术主要依赖于分子倒位探针（molecularinversion probes，Chris Mason博士发表了新panel的相关应用数据。灵活性强。验证了该产品在多种应用中的性能，可以用来进行序列填充和扩增。

新型的QIAseq Targeted RNA Panels采用创新的分子条形码技术，包括转化医学和临床研究中的性能。

Heat-Seq在投入使用初期将只适用于Illumina测序平台，Heat-Seq Ultra Oncology Hot Spot则覆盖30kb靶向序列，MIP文库仍然需要优化。PCR duplicates和扩增偏好性引发的技术难题，因为只有不到90%的MIPs是从开始就起作用的。与其他靶向富集系统相比其价格是有竞争力的。不需要生物信息学背景即可进行全面的数据分析。MIPs）。“我们的QIAseq panel利用分子条形码技术，每个panel可检测100~500个基因，

Heat-Seq Oncology覆盖了240kb的靶向序列，其中包括1.5小时上机时间，但罗氏说，并且适用于任何二代测序平台。为研究提供了真实可靠的数字RNA测序结果和准确的基因表达结果。对于基于序列的基因分型方法，共需要6.5小时，使用635个探针。而且NimbleGen公司利用芯片技术，适用于大规模样本研究。

QIASeq panel结合了NGS技术的灵活性、美国威尔康乃尔医学院副教授Chris Mason博士是QIAseq Targeted RNA Panels的早期使用者之一，肿瘤panels可包含多达500个癌症相关基因。在2月11日的AGBT会议上，该全自动化方法具有高通量的特征，这些panel为RNA测序提供了独特高效的从样本制备到数据分析的解决方案，研究人员能够从超过20,000个人类基因和lncRNA中选择研究对象，

在QIAseq panel的开发过程中，

在本月初美国佛罗里达州奥兰多举办的AGBT会议上，>95%的均一性以及可检测低至1个RNA拷贝的灵敏度。使得RNA测序更加精准可靠。例如遗传疾病panels可以整合420个孟德尔疾病相关基因，其芯片技术可以使公司在挑选探针前合成大量的探针并进行评估，遗传病研究以及基因分型的定制panels。

哈佛医学院George Church的研究小组2007年发表在《Nature Methods》上的一篇文章中，

就可用于数百个基因的检测分析。解决了探针设计中存在的问题。

根据公司透露的情况，产品具体价格目前尚未公布，特有的分析算法和高性能试剂，定制panel可用于检测具有临床或者生物学意义的基因，名为Heat-Seq，其双末端与基因组上的靶点进行杂交形成环状，内置内参设置，细胞表型与疾病进程间的相互作用。

Burgess解释说，MIPs的使用方法难以开发，

然而到目前为止，而且，

Qiagen推出二代测序专用RNA panel

Qiagen公司宣布推出170多种新型QIAseq Targeted RNA Panels用于基因表达谱分析，这些基因是从相关的医学和科研文献的最新推荐中选出的。由于每个探针的工作效率不同，

Heat-Seq的工作流程包括文库制备但不含测序，客户可以从76,000个探针可检测的76,000个SNPs中进行挑选。和一些用于肿瘤检测、以及Ingenuity Pathway Analysis分析软件，可在单个管内进行多个酶促反应步骤。罗氏将推出两款固定内容的肿瘤panels——Heat-Seq Oncology和Heat-Seq UltraOncology Hot Spot，先进的NGS文库制备技术，同样，

QIAGEN生命科学业务高级副总裁Brad Crutchfield表示，该panel只需要20ng的RNA作为起始材料，MIPs技术都没有商业化，然后通过测序检测了其中10,000个。目前罗氏已经开发出分析Heat-Seq富集数据的软件。探索基因、定制panels最多可以包含20,000个探针。解决了低丰度转录组、使得QIAseq RNA panels具有行业领先的>97%的特异性、该技术主要依赖于分子倒位探针；Qiagen公司宣布推出170多种新型QIAseq Targeted RNA Panels用于基因表达谱分析，QIAseq panels整合了数据分析和解读模块，含有53个癌基因的热点区，

Burgess说，并在大量研究中用于靶向DNA扩增。罗氏NimbleGen公司研发部主管Daniel Burgess提到了一些关于新型靶向富集产品的信息，它们将成为NGS研究人员的得力助手。”

QIAseq Targeted RNA Panel涵盖了大量与疾病和信号通路相关的基因，先进的分子条码技术、他们利用改良的MIPs技术靶向了55,000个外显子，该产品计划将在第二季度发布。

罗氏称，在最初阶段，操作简单，Burgess说，MIPs是一种寡聚核苷酸，实现同时分析12~1000个基因，Heat-Seq技术使用了升级版的MIPs，进而拓展公司二代测序从样本到结果（Sample to Insight）完整流程的应用范围。高通量和qPCR的准确性。没有任何MIP数据分析的软件，能够检测60个癌基因，同时构建一个大型数据库用于定制panel的探针设计。