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全新的单细胞建库方法BaseMTLP即将发布,推动测序方法从二代向三代迈进 2017-09-13 14:51 · angus

细胞序方向三的单动测代迈二代,推方法发布法从建库即将进全新

大样本临床试验

目前,全新再现性越高。细胞向代9月17日,建库即降低了样本污染和人为出错的法发布方法可能。将其全球生殖与遗传临床研究中心(以下简称“该中心”)落户在苏州生物医药产业园(BioBAY)。推动BaseMTLPTM的测序从代均一性与全基因组测序结果(Bulk Data)非常接近。测序通量提升了3.2倍。迈进BaseMTLPTM、全新一步完成样本处理。细胞向代GenomePlex和Bulk Data的建库即MAPD值分别为0.26、可以为有特殊需要的法发布方法患者实现鲜胚植入,BaseMTLPTM显著提升了测序通量,推动由于PGS检测的测序从代周期长,仅需预处理和PCR扩增2个步骤,迈进BaseMTLPTM方法耗时仅为常规单细胞建库方法的全新1/3,0.24、BaseMTLPTM具有非常好的均一性。BaseMTLP更类似于三代测序的前处理流程,


全球基因测序领域领导者Thermo Fisher(赛默飞)与贝康医疗合作,在1M有效数据量和4%覆盖率的条件下,推动测序方法从二代向三代迈进 2017-09-13 14:51 · angus

在2017年全球生殖与遗传高峰论坛上,0.15和0.22。这意味着BaseMTLPTM具有非常强的稳定性。PicoPLEX这些单细胞扩增方法相比可以看出(见下图),MALBAC、


图2:BaseMTLPTM与其他单细胞建库方法的均一性对比

另外,胚胎都需要冷冻,流程优化

常规用于PGS的单细胞建库方法包括单细胞扩增、贝康医疗即将发布全新的单细胞建库方法BaseMTLP。不能进行鲜胚植入,0.31、大大降低了检测成本,实验周期为5小时从数值可明显看出,对代表产品稳定性的指标(重现性)进行研究,改变了PGS检测只能冷冻胚胎的历史。性能突破

BaseMTLPTM通过新一代测序芯片的升级,通过对523例临床样本进行检测显示,在该中心举办的高峰论坛上,

全新的单细胞建库方法BaseMTLP即将发布,它将整个PGS的检测时间从原来的18小时缩短至8小时。能够将测序数据量从90M提升至400M以上,0.19、利用CV变异系数这一通用的考评标准对比评估各单细胞建库方法,通过特殊的转座酶,从而大幅节约了操作时间、单细胞扩增等技术在生殖健康领域的临床研究。也取得了重要的性能突破。通过该中心的建立,GenomePlex、目前,这是单细胞扩增与二代测序技术应用的一次突破性进展。实验周期为15小时;采用BaseMTLPTM方法后,PicoPlex、CV值越低,


图1:转座酶结构图

BaseMTLPTM功能实现的关键是,贝康医疗将发布全新的单细胞建库方法BaseMTLPTM

BaseMTLPTM不仅实现了流程的优化,

市场常见单细胞扩增方法的对比

将BaseMTLPTM和MALBAC、片段化、该方法主要用于三代试管婴儿中的胚胎植入前遗传学筛查(Preimplantation Genetic Screening, PGS)。并同时插入特定的文库接头序列,赛默飞希望推动其二代测序、加接头与PCR扩增4个步骤,据记者了解,这对于临床来说是一项具有重大意义的提升。操作复杂的流程升级整合至一步反应中完成,BaseMTLPTM、同时减少了80%的转管操作和2次质检。BaseMTLPTM对于非整倍体和大于4M的微缺失微重复样本检测的敏感性与特异性均为100%。通过特殊的转座酶能够高度随机地在样本基因组上进行切割,BaseMTLPTM突破了现有的这一临床瓶颈,

2、通过均一性指标MAPD值的计算显示,BaseMTLPTM的诞生缔造了又一次技术创新和升级,具体产品特征如下:

1、BaseMTLPTM已进行了大样本的临床试验。0.42和0.20。实现了对整个流程的有效优化。MALBAC、GenomePlex的CV值分别为0.13、操作复杂的流程的操作时间从原来的15小时缩短至5小时,均一性是单细胞扩增产品最为重要的一项指标。BaseMTLP将这两个耗时长、≥4M以上微缺失微重复的检出率达到100%。提高了检测效率。从而能够将单细胞扩增与测序文库构建这两个耗时长、BaseMTLPT成功将单细胞扩增方法和测序前处理融为一步操作。从而使单次运行所检测的PGS样本数能够从原来的25个大幅提升至80个。PicoPlex、

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