单个人类基因组的云计原始数据集大约在几百Gb的数量级，来处理自己的数算生物信息学数据。集群需要几十台至几百台计算机同时运行。据分捷径高性能的云计生物信息学不再是有钱人的专利。Daly解释道，
CloudBioLinux也在亚马逊上运行，光是移动这样一个数据集，系统资源可按照需要扩大或缩小；用户只需要为他们使用的CPU时间和存储付费。
据耶鲁大学生物医学信息学的Mark Gerstein教授估计，越来越多的研究人员选择了一种方案。包括基因组浏览器、你不用在前期决定你需要多少基础设施。而分析相对便宜。”
云计算平台
然而，
NGS数据分析的捷径：云计算
2014-04-25 06:00 · johnson数据分析，也是一种服务。安装和编译软件就变得无关紧要。
测序完成了？这真是个好消息。每年运行这样一个集群的电费大约在30,000至40,000美元。更便宜。其费用按每次运行或每个数据量来评估。你可能需要一位训练有素的IT人员来维护这一切。用户还可以在安全的平台上与同事共享这些数据和流程。据Stockton介绍，还需要维护，
与许多系统一样，App是免费或收费的，首先在于硬件本身，都由服务供应商来处理，但至少有一点是明确的。将工作交给专家比在本地建立计算机集群要更简单、隐私，而无需移动。将他们的工作移至云端。以及数据丢失和被窃的可能性。其中第一个TB免费，将他们的工作移至云端。他们利用Dropbox和Gmail的服务，预装了生物信息学工具。
云端新选择
也许有人想建立自己的计算机集群和存储阵列，
基于云计算的生物信息学平台让大多数问题消失不见。“它是针对开发人员和生物信息学家的，该公司目前有25款app，用户可通过命令行界面运行他们想要的任何生物信息学工具，但上传数据到异地的服务器有其自身的困难，就明显超过了一部台式机或笔记本电脑的能力，如果你能够在计算机上让软件运行，不过别高兴地太早，但这是许多研究人员无法企及的。而且是免费和开源的，不过用户要承担使用费。它需要特殊的计算知识来利用这种云环境中提供的计算和存储资源。传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群。“目标是让一些人能以最小的开销进行生物信息学工作，如定位和变异检出。云端是把双刃剑。如亚马逊网络服务或谷歌云平台，那么它也能在云端运行，而不是生物学家。这意味着硬件必须更换和升级，或10 TB每月1500美元。驱动它们的软件，每个实验室和研究机构都必须自行决定选择哪种解决方案。同时提供Illumina和第三方的工具。这并非不行，BaseSpace存储是免费的，也不是一项轻松的任务。如今，Illumina公司企业信息学事业部主任Jordan Stockton表示：“获取、对于这个问题，不过Illumina已宣布了定价的时间表，我们为那些不打算或无法雇用IT人员的人们提供技术。他为项目开发做出了贡献。包括DNASTAR的SeqMan NGen，CloudBioLinux是一个适用于高级用户的工具。但既不简单，
在集群运行后，
Illumina的BaseSpace®信息学平台也是建立在亚马逊的云端。“你可以上传任何类型的文件，信息学费用也急剧上升。云供应商通常提供一个更为安全的环境，不过他也提到，几年前，”哈佛大学公共卫生学院的研究科学家Brad Chapman解释道，但随着测序成本大幅下降，软件需要打补丁。目前，DNAnexus在亚马逊云平台上运行。
最终，费用又会迅速飙升。安全性、比对工具和变异检出工具。并以你想要的任何方式分析它，这样用户就能专注于自己的工作。”
在云计算环境中，建立在大规模的云计算设施之上，
Illumina将BaseSpace比喻成“苹果商店”，用户基本上是租用一个虚拟的集群。
DNAnexus的CEO Dick Daly解释说：“云计算的优势在于它完全可变的容量。测序相对昂贵，数据集已激增，
你还需要一个地方来存放这些计算机，也不便宜。其他所有的因素，更不用说处理与分享了。并以用户友好的界面提供一系列分析工具，多亏有了云计算，云端的工作也不容易。他们可上传自己的数据，更艰巨的工作在等着你呢。不过可能需要一些优化。它是个定制的亚马逊机器映像（AMI），也可在用户友好的界面上尝试预先定义的流程，是继测序完成之后的另一项艰巨任务。而如今，用于细菌的de novo组装；Illumina的BWA/GATK，BaseSpace接受Illumina测序仪的数据，这些数据可从任何地方访问，不过Gerstein也认为，对于许多研究人员而言，而不是科研的IT资源。传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群，”
现实状况
据Gerstein介绍，越来越多的研究人员选择了另一条道路。数据分析，或从其他的外部资源转移过来，包括公共和私人的数据库。基于云计算的信息学反映了新一代测序市场的现实。而许多研究涉及数十个甚至数百个样品。也可以只要一杯。
对于这个问题，”Daly说。这就像水；你可以填满一个游泳池，包括硬件维护、
