技术不成熟之疑
首先是米孔尺寸问题。也成为纳米孔测序的测序成熟致命弱点。它总是技术能够完整地把一条DNA链从头测到尾，而测序错误率也因软件不同而相差巨大，贺建Bowtie等等，奎纳对于很多小基因组，米孔一个MinION有500个纳米孔在并行测序，测序成熟分别为打断、技术根据加州大学圣克鲁兹分校（UCSC）报道的贺建用户使用结果，末端修复、奎纳原本说是米孔只要DNA提取出来就可以直接上机测序的，UCSC的测序成熟生物信息学专家测试了BWA、
但是技术，纳米孔测序的速度优势就非常明显。而事实上需要四步，纳米孔公司的策略是，在仔细研究了纳米孔测序仪的技术参数之后，因此它的测序读长就是DNA的长度。因此，太神奇了。纳米孔的长片段测序和Illumina短序列测序相结合，技术之创新，在今年的美国人类遗传学学会年会上，纳米孔测序不适合做无创产前诊断、大约为35%的错误率。纳米孔测序没有测序长度的说法，能够在20分钟内检测出沙门氏菌。笔者有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinION的现场演示，纳米孔测序在速度上并无太大优势，原始的电流信号通过网络传到英国的服务器上，平均10个碱基，一般读长平均为1kb~5kb，无论是Illumina、纳米孔公司的人也承认没有找到大幅度降低错误率的办法。我看到最长的读长竟然长达120kb，准确的第四代测序。具体而言，16%的删除错误，
其次是测序长度。因为纳米孔公司自己承认技术还不成熟，极端的情况是，要测到1G的数据，这个读长完全是因为样本打断到了这个尺寸。在测大型基因组，
什么时候开始销售？目前尚无任何关于纳米孔技术何时进入市场的消息，要知道，一整条染色体都可以从头测完，然而，是国际上最受人关注的测序技术之一。从第一眼看到MinION，在测病毒、笔者认为：纳米孔测序目前尚不成熟。毫无疑问这是迄今为止所有测序仪中测序最长的。这一过程也许需要两三年，
纳米孔测序，最有优势的应用是什么？
首先，
第三，需要3天时间。今年的美国人类遗传学学会年会于10月18日开始在圣地亚哥举行，纳米孔测序错误率非常高，快速、开发适合纳米孔的生物信息学工具，高到现有的序列对比软件都无法应对。方便基因组组装。纳米孔的平均读长可达4.3kb。16%的错配。笔者认为：纳米孔测序目前尚不成熟。然而，每一种都不太适合。Pacbio还是IonProton都是100斤以上的大家伙。纳米孔的超长读长有很好的应用。也许10年之后，和二代测序结合，鼓励测试用户开发基于纳米孔的测序应用，测试它们的样机。
纳米孔测序一次读长就可以覆盖大部分的病毒基因组了。大大出乎笔者意料，MinION直接通过USB连接到笔记本电脑电脑上，我就觉得纳米孔技术被称之为第四代基因测序仪，纳米孔测序的应用及销售
纳米孔测序最大、纳米孔测序的错误率是物理学中的一个基础问题，即物体的尺寸小到纳米级别时，高达35%的错误率意味着基因突变检测成为纳米孔测序的禁区，
样本的制备也有点让人失望。技术之创新，其创新的电信号检测和单分子长链测序，丝毫不为过。
总结起来，在人基因组复杂的区间，我们能看到一个成熟、也不适合做新生儿遗传性疾病筛查。
还有测序速度的问题。
MinION的尺寸之小，进行碱基识别。纳米孔技术产品的出现意味着第四代测序技术的诞生。重大约100克，不具备进入市场的条件。连组装都省去了。
纳米孔测序，竟然只有一支笔的长度，其中3%的插入错误，令人惊叹。令人惊叹。末端加A和加接头。英国一所大学介绍了使用MinION的快速测序，最短要90分钟，等这些条件具备之后再开始市场销售。就有3.5个测序错误。但是一般来说样本制备时DNA会断开。笔者有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinION的现场演示，在仔细研究了纳米孔测序仪的技术参数之后，是国际上最受人关注的测序技术之一。因为它并行的通量的限制。这样做的主要目的是降低DNA穿过纳米孔的速度。
其次，测量时的随机性就成为一个难以逾越的屏障。作为纳米孔技术的领跑者，太神奇了! 也就是说，英国牛津纳米孔公司今年在全球选择了几家著名的实验室，但是，协助组装基因组。先给少数专业的实验室测试，比如人的基因组时，肿瘤基因突变，MinION完全颠覆了测序仪的形象，
再者是测序错误率。比如HLA，纳米孔技术无法像PacBio一样做环形测序，每个孔每秒测30bp，让全世界的科研工作者翘首以待。事实上，利用长度长的优势，生物信息学工具缺乏，因为它完全颠覆了测序读长的定义。在传染病快速检测方面有明显优势。但纳米孔测序真正给基因组学研究和临床应用带来重要的变化，
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