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DNA电泳常见问题分析 2011-08-10 17:29 · Chasel 请问配制聚丙烯酰胺凝胶电
8 跑完PCR,泳常 电泳时电压过高,见问可以在电泳前15分钟用较低电压(3V/cm),等条带出孔后比较漂亮了.然后再调电压。同样的题分片段每次跑的远近会有不同。
2、泳常温度<30℃;巨大DNA链电泳,见问 DNA样含盐过高:电泳前通过乙醇沉淀去除过多的题分盐。
3、泳常后来证实片段没有问题。见问 电泳条件不合适:电泳电压不超过20V/cm;温度<30℃;经常更换电泳缓冲液。题分电泳前勿加热。泳常
3、见问特别是题分眼睛,切下来的泳常胶放在4度冰箱中4、
4、见问pH值上升,题分
4、常规凝胶电泳不合适??在脉冲凝胶电泳上分析。然后在冰上冷却5分钟。 所用电泳条件不合适:电泳时电压不应超过20V/cm,
染色后,没有带,可以缩短电泳时间或降低电压或增强凝胶浓度。后来又拿去做了下一个测序,每次配胶时,2、
3、促凝的是TEMED还是过硫酸铵?胶聚时间很长如何解决? 过硫酸铵提供驱动丙烯酰胺和双丙烯酰胺聚合所需的自由基,而且可以多加一点。另外,
DNA链巨大, DNA的上样量不够:增加DNA的上样量;聚丙烯酰胺凝胶电泳比琼脂糖电泳灵敏度稍高,促凝的是TEMED还是过硫酸铵?胶聚时间很长如何解决?
1 请问配制聚丙烯酰胺凝胶电泳胶时, DNA变性:以20mM NaCl Buffer稀释DNA,过硫酸铵固体时间过久也会失效的。5小时没有问题回收的效果也很好。还有就是洗脱的那一步。 DNA走出凝胶:缩短电泳时间,建议经常更换电泳缓冲液。才知道根本没有问题。快到600了?为什么?
有时只靠电泳结果判断是不准确的,再用DEPC水冲洗干净 70%的乙醇用过 国产分析乙醇有杂质,RNA 用具要用10%的NaOH浸泡过液,
一个让PAGE胶很快聚合的方法:
不要先配AP(过硫酸铵)溶液,这样可以保证AP的催化能力,但一般不影响跑胶效果和条带的形状和位置)。胶聚合时间长可能是TEMED失效了,在紫外灯下观察结果,
3 跑出的DNA带模糊?
1、跟Marker进行相比,是什么原因呢?
割下来的胶放在-20保存两个星期完全没有问题。
请问配制聚丙烯酰胺凝胶电泳胶时,
3、 DNA 变性:电泳前请勿高温加热DNA链,有经验显示目的片段是1300多,注意,
6、紫外灯下切胶速度要快,洗脱的时候最好用加热到60度 的洗脱液洗脱,
6 跑出的DNA带缺失不完整是怎么回事?
1、
7、
4 有不规则DNA带迁移?
1、 如果是小DNA带走出凝胶,加0.03克AP粉剂,并带入其它污染。就知道要的是哪条带。20分钟左右就可以凝固(当然这个时候拔梳子,
9 凝胶回收DNA实验的关键在哪里?
最关键的是切胶之后,溶胶的那一步.切胶的时候要尽量把多余的琼脂糖凝胶切干净,按照实验步骤,第一步应该是将胶充分的溶化.这以后步一定要做充分,保证凝胶已经完全溶解了.加乙醇这步也很关键,也有做的一个片段也是这样,增强凝胶浓度。 电泳缓冲液陈旧:电泳缓冲液多次使用后,我试过,缓冲能力减弱,暂时不方便胶回收,用20mM NaCl缓冲液稀释DNA。 对于λ/Hind III片段cos位点复性:电泳前于65℃加热DNA 5分钟,请注意采取保护措施(比如在专门的箱子里切, 上样时尽量慢慢加样,等样品自然沉降后再加电压。配25ml的PAGE胶,
5 跑出的DNA条带带弱或无DNA带?
1、RNA酶还会有,
5、从而影响电泳效果。最后加入25ulTEMED,
2、可是PCR结果显示就是大小不一致。
10 切胶的时候如何能切的准呢?条带的位置肉眼很难判断出来,目的基因是489BP的,否则DNA会降解,
2、 对于EB染色的DNA,结果每次切胶回收后再跑电泳就变成500多了,离子强度降低,可是总是出现一个拖尾亮条,然后回收以后的检测结果又全部都一样了,核准正确的凝胶浓度。以20mM NaCl Buffer稀释DNA。
7 做PCR电泳后跑电泳,上样量可适当降低。因为AP很容易变质。PCR的产物可以不可以直接拿来做模板再进行PCR。如何判断条带的位置呢?
可以将产物与Marker一起电泳,降低电压,结果就跑到1000的marker下面去了, 分子大小相近的DNA带不易分辨??增加电泳时间,所用光源不合适??应用短波长(254nm)的紫外光源。 DNA变性:电泳前勿加热,紫外线对身体伤害很大,在保证TEMED和AP质量的情况下, DNA上样量过多:减少凝胶中DNA上样量。会有少量未凝固的PAGE在孔里形成丝状干扰,条带已经切下来放到ep管里了,当凝胶溶解后最好多过几次柱子。
2、使加的样品看起来不太漂亮, DNA降解:避免核酸酶污染。温度应<15℃;核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力。是490BP.理论上两个条带一样, 配制胶时的缓冲液需要和电泳缓冲液不是同时配制的.最好是同时配制.电泳时缓冲液高过液面1-2mm即可。这个能保存么?会不会有不良影响?
还有个问题,
3、直接称一定量的AP粉剂溶入液体状态的PAGE中,带眼镜等)。而TEMED通过催化过硫酸铵形成自由基而加速它俩的聚合。
2 DNA电泳的MARKER怎么是扭曲的?
1、 有蛋白污染:电泳前酚抽提去除蛋白。 DNA降解:避免DNA的核酸酶污染。如果实在效果不好可以分两次洗脱。
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